細胞認証ってなになになーに？

と 今や培養細胞は生命科学の研究で必須のモデル系、たくさんの実験に使用されているね！ だけど細胞株の取り違えや他の細胞株のコンタミが原因で、 知らないうちに自分の意図しない細胞で研究を進めてしまうことがあり、深刻な問題になっているよ。 このような事態を防ぐため、投稿時に細胞認証を求めるジャーナルが増えているんだ。 なになになーに？ ほたるん Vol.3 エビビン 細 胞 認 証って A 細胞に別の細胞が混ざってないか、 うっかり間違った細胞を使ってないか、確かめる作業だよ！ こんにちは、ほたるんさんエビビンさん。 「Nature」の投稿規定が変わり、 ヒト由来の培養細胞を使った論文を投稿するときに 「細胞認証」が必要になったのだそうです。 「細胞認証」って何ですか？ Q プロ メガ子より ● Nature 出版グループの学術誌（Nature など 8 誌） ● AACR ピアレビュー学術誌（Cancer Discovery など 7 誌） ● Endocrine Society ピアレビュー学術誌（Endocrine Reviews など 5 誌） ● Society for Endocrinology ピアレビュー学術誌（Endocrine-Related Cancer など 3 誌） ● Journal of the National Cancer Institute　 ● International Journal of Cancer　 ● Carcinogenesis ● Neuro-Oncology ● Cell Biochemistry and Biophysics ● Cell Biology International　 ● Journal of Molecular Biology　 ● In Vitro Cellular & Developmental Biology ‒ Animal　 ● Molecular Vision ● Placenta 投稿時に細胞認証が必要なジャーナル（ ） 細胞誤認はどうして起こる？ 細胞誤認ってそんなにあるの？ がん研究をしていない人、 Natureに投稿しない人は関係なし？ ついにNatureでも！ JCRB 細胞バンクで受託検査を行った ヒト細胞株のクロスコンタミ率 平成 24 年度 平成 25 年度 平成 26 年度 平成 27 年度 （7 月現在） 16.4% 11.1% 11.1% 12.9% 細胞名の 記載ミスとか ベンチ作業での ピペットのリユースで クロスコンタミとか 2015 年 7 月現在 がん関連誌が 多いよ ヒトの細胞だと思ってたら 他の動物のだった、 なんてこともあるよ 間違った細胞で変な実験結果が出たり、 追試ができないと、 今までの時間も努力も研究費も 水の泡だよ どうすればいいの？ ゲノムの中には 「STR」という短い繰り返し配列が ある場所があるよ （場所のことを「ローカス」って呼ぶとかっこいいね！） 繰り返し回数は 細胞株によって異なるから、 区別の目印になるよ 特定の場所の 繰り返し回数を調べて既存の データベースと比較すれば、 細胞株の同定ができるよ ローカスの数を増やすほど識別能力が高まるよ！ 型の違いで 区別できるよ データベースとの照合 STR 解析だよ！ （Short Tandem Repeat） 細胞認証データの 確認検索サイトだよ！ （医薬基盤・健康・栄養研究所細胞バンク） http://jcrbcelldata.nibio.go.jp/str/database 遺伝子型データを入力すると JCRB 細胞バンクが保有している 約 800 種の細胞株と 照合することができるんだ。 繰り返し回数 ‖ 「遺伝子型」 というよ ゲノム中の、あるローカスに AATGの繰り返し配列があるとするよ （ヒトは 2 倍体だからゲノムが 2 セットあるよ） ローカス数 適合頻度 豆知識 10 29 億分の 1 未満 ＊1 細胞認証には少なくとも 9 ローカスのデータが必要だよ 16 100 京分の 1 未満 ＊2 iPS 細胞の研究では 16 ローカス調べているよ ＊1　GenePrint® 10 System を使用した場合　　＊2　PowerPlex ® 16 System を使用した場合 細胞株 A 細胞株 B 繰り返し 5 回 AATG AATG AATG AATG AATG AATG AATG AATG AATG AATG AATG 繰り返し 6 回 繰り返し 3 回 AATG AATG AATG AATG AATG AATG AATG AATG AATG AATG 繰り返し 7 回 5, 6 3, 7 繰り返し回数は どうやって調べるの？ ローカスを PCR で増やして、 断片の長さから 算出するよ だいたい 同じでーす 顕微鏡観察？ 重さを測る？ だいたい 同じでーす 正しい細胞株かどうかなんて どうやって証明すればいいの？ 細胞認証のきほん ～ STR 解析～ 警察の DNA 鑑定 にも使われる 方法だよ！ データベース化 しやすいんだ！ 「まさか！」から 研究成果を 守るための作業ね！ 早速申し込まなくっちゃ！ 自分で立ち上げるなら 受託サービスを利用するなら ウェブサイトから 申込み FTA カードに 細胞をたらす 細胞認定書ゲット！ STR-PCR 試薬 フラグメント 解析用ソフト キャピラリー 電気泳動装置 ● 解析ファイルのインポート ● キャリブレーション ● PCR 条件最適化 など 返送 解析 FTA カード が届く 1 申込み 2 サンプル送付と結果受け取り 2 週間 必要なもの 立ち上げ作業 消耗品 ヒト以外の生物種由来の 細胞株は解析できますか？ 1 できません。ヒトだけです。 細胞株の コンタミネーションは 検出できますか？ 3 10-30% コンタミネーションが あれば検出可能です。 STR 解析は 自分で できるかしら できるけど、 頻繁でないなら 受託サービスの メリット は大きいよ！ 同じ細胞の未分化細胞と 分化細胞や、同一人物由来の 組織を判別できますか？ 2 ゲノム情報に変化がないため、 STR 解析で判別することは できません。 ヒト細胞認証（STR-PCR） 受託サービス 1 検体 ¥45,000（納期 2 週間） ● 16 ローカスの解析結果 ● 論文投稿にすぐ使える細胞認定書つき たまにある質問 ルーチンでたくさんの サンプルを解析するなら コスト削減できるね テクニカルサービス ● Tel. 03-3669-7980 ／ Fax. 03-3669-7982　● E-Mail : prometec@jp.promega.com PK1507-02 販売店 日本語 Web site：www.promega.co.jp プロメガ株式会社 本 社 〒103-0011 東京都中央区日本橋大伝馬町14-15 マツモトビル Tel. 03-3669-7981／Fax. 03-3669-7982 大阪事務所 〒532-0011 大阪市淀川区西中島6-8-8 花原第8ビル704号室 Tel. 06-6390-7051／Fax. 06-6390-7052 ※製品の仕様、価格については2015年7月現在のものであり予告なしに変更することがあります。