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ProDye™ Terminator Sequencing System

シーケンシング反応液の精製にBigDye XTerminator® Purification Kitは使えますか?

シーケンシング反応液の精製にBigDye XTerminator® Purification Kitをご利用いただくことは可能です。

ただし、社内検証におきまして、BigDye XTerminator® Purification Kitを使用すると、Dye Blobsを生じる傾向にあることが分かっています。

より鮮明な解析結果を得るため、エタノール沈殿でのシーケンシング反応液の精製を実施してください。

＊Dye Blobs：シーケンシング反応が不十分であったり、精製で未反応の蛍光標識ヌクレオチドが完全に除去されず、"C"や"T"などの幅の広いピークが現れる現象です。シークエンスデータの最初の100bp付近までで見られます。

（上図）Dye Blobsの例。pGEM®-3Zf(+) Control plasmidを対象に、ProDye™ Terminator Sequencing Systemにてシークエンス反応後、BigDye XTerminator® Purification Kitにて精製を行った。丸で囲った領域において、"T"や"A"などの幅広いピーク（Dye Blobs）が見られる。