PCR基本情報
- どの耐熱性DNA polymeraseが非鋳型依存的に3’末端にAを付加しますか。
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3´→5´ exonuclease活性を欠いた耐熱性DNA Polymeraseは鋳型に依存せずにヌクレオチド(通常はdATP)を増幅産物の3’末端に付加します。このような酵素には、Taq DNA Polymerase、Tfl DNA Polymerase、Tth DNA Polymeraseが含まれます (表 1)。polymeraseが3´→5´ exonuclease proofreading活性を持つ場合、 この活性によって鋳型に依存しないヌクレオチドは除かれ、平滑末端を有する産物となります。これらの酵素にはTli DNA Polymerase、Pfu DNA Polymeraseなどが含まれます。(PN71-Q&A)
表1.耐熱性DNAポリメラーゼの特徴
特徴 Taq DNA Polymerase Tfl DNA Polymerase Tth DNA Polymerase Tli DNA Polymerase Pfu DNA Polymerase 由来 Thermus Aquaticus Thermus flavis Thermus thermophilus HB-8 Thermococcus litoralis Pyrococcus furiosus 分子量 94kDa 94kDa 94kDa 90kDa 92kDa 半減期(95℃) 40分 40分 20分 400分 ※ 伸長率(nt/sec. @72℃) 60~150 ※※ 25 67 ※ 逆転写活性 低レベル 低レベル 〇
(Mn2+依存性)× ※ サイクル半減期 50サイクル 50サイクル 25サイクル 500サイクル ※ 3'Aの付加 〇 〇 〇 × × 5'→3' エクソヌクレアーゼ活性 〇 〇 〇 × × 3→'5' エクソヌクレアーゼ活性 × × × 〇 〇 ※データー無 ※※解析中
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